Keragaman Morfometrik dan Gen cytochrome b DNA Mitokondria Ompok hypopthalmus di DAS Batang Hari.

Abstrak

Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis keragaman morfometrik dan gen cytochrome b (cyt b) DNA mitokondria Ompok hypopthalmus di DAS Batang Hari. Data struktur morfometrik diukur untuk 12 karakter. Amplifikasi gen cyt b DNA mitokondria dilakukan secara polymerase chain reaction (PCR) menggunakan primer cbkr 1: 5’-CCCGAAAAACTCACCCCTTA-3’ dan cbkr 2: 5’-ATAGCCCGGTTAGAGGGTTT-3’,dan hasil amplifikasi dirunut dengan target 1104bp nukleotida. Hasil analisis menunjukkan bahwa struktur morfometrik O. hypopthalmus di DAS Batang Hari tidak berbeda nyata antar lokasi pengambilan sampel. Hasil ini konsisten baik untuk karakter morfometrik (p=0.96) maupun indeks (nisbah) struktur morfometrik (p=0.99). Analisis gen cyt b DNA mitokondria menghasilkan runutan sepanjang 927 bp dengan komposisi terbesar berupa sitosin,dan komposisi terkecil adalah guanin. Hanya terdapat satu nukleotida (0.11%) yang berbeda pada seluruh runutan O. hypopthalmus DAS Batang Hari yaitu nukleotida ke-976 dari gen cyt b utuh. Nukleotida pada O. hypopthalmus dari Simpang dan Sungai Bengkal adalah guanin, sedangkan pada O. hypopthalmus dari Mandiangin dan Pelayangan adalah adenin. Substitusi nukleotida ini terletak pada kodon pertama dan mengakibatkan terjadinya perbedaan asam amino putative ke-309. Asam amino ke-309 pada O. hypopthalmus Simpang-Sungai Bengkal adalah alanina(GCC), sedangkan pada O. hypopthalmus Mandiangin-Pelayangan adalah treonina(ACC).