Studi molecular docking senyawa 1,5-benzothiazepine sebagai inhibitor dengue DEN-2 NS2B/NS3 serine protease

Penulis

  • Neni Frimayanti Sekolah Tinggi Ilmu Farmasi Riau
  • Anita Lukman
  • Livia Nathania

DOI:

https://doi.org/10.22437/chp.v6i1.12980

Kata Kunci:

molecular docking, panduratin A, inhibitor of dengue fever, 1,5 benzothiazepine

Abstrak

Studi molecular docking senyawa 1,5-benzothiazepine turunan kalkon dengan protein target dari permodelan struktur kristalografi Protease dengan kode 2FOM dilakukan dengan komputer menggunakan program Molecular Operating Environment (MOE). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi senyawa 1,5-benzothiazepine sebagai inhibitor virus dengue menggunakan studi molecular docking dengan mengamati interaksi antara senyawa 1,5-benzothiazepine dengan reseptor NS2B/ NS3 Protease menggunakan Panduratin A sebagai kontrol positif. Sehingga dapat dijadikan acuan dalam desain inhibitor NS2B/ NS3 Protease. Berdasarkan hasil docking yang telah dilakukan menunjukkan senyawa MA10, MA11 dan MA12 berpotensi aktif sebagai inhibitor NS2B/ NS3 Proteasedengan nilai energi bebas ikatan sebesar -5,0142 kcal/mol, -4,9782kcal/mol, dan -4,9778kcal/mol dan memiliki beberapa kesamaan residu asam amino yang sama dengan kontrol positif (Panduratin A).

Unduhan

Data unduhan belum tersedia.

Referensi

Ameta, K. L., Rathore, N. S., & Kumar, B. 2013. Synthesis And Preliminary Evaluation Of Novel 1, 5-benzothiazepine Derivatives as Anti-Lung Cancer Agents. Int. J. Pharm, 3(2), 328-333.

Candra, A. 2010. Demam Berdarah Dengue: Epidemiologi, Patogenesis, dan Faktor Risiko Penularan. ASPIRATOR-Journal of Vector-borne Disease Studies, 2(2).

Candra, A. 2019. Asupan Gizi dan Penyakit Demam Berdarah/Dengue Hemoragic Fever (DHF). JNH (Journal of Nutrition and Health), 7(2), 23-31.

Gaikwad, S. 2013. Synthesis and Antimicrobial Study of Novel 2,3-diydro-4-(naphtho [2,1-b]furan-2yl)-2-substitued [1,5]benzothiazepines. Journal of Chemical, Biological and Physical Sciences. 3(2): 936-940.

Garg, N., Trilok, C., Archana., Amit, B.J., and Ashok, K. 2010. Synthesis and Evaluation of Some New Substituted Benzothiazepine and Benzoxazepine Derivatives as Anticonvulsant Agents. European Journal of Medicinal Chemistry. 45: 1529–1535.

Hardani, M., Ramadhian, M. R., & Wahyudo, R. 2018. DENV-5: Ancaman Serotipe Baru Virus Dengue. Majority.

Huey, R., Morris, G. M., dan Forli, S. 2012. Using AutoDock 4 and AutoDock Vina with AutoDockTools: A Tutorial. The Scripps Research Institute. California.

Kitchen, D. B., Decornez, H., Furr, J. R., dan Bajorath, J. 2004. Docking and Scoring in Virtual Screening in Drug Discovery, Methods and Applications. Nat. Rev. Drug Discov, 3: 935-949.

Lins L, Brasseur R. 1995. The Hydrophobic Effect in Protein Folding. Faseb J. 9: 535-540.

Lodish, H., Berk, A., Zipursky, S., Matsudaira, P., Baltimore, D., & Darnell, J. (2000). Mollecular Cell Biology 4th Edition. W.H Freeman Company. New York.

Muttaqin, F. Z. 2019. Studi Molecular Docking, Molecular Dynamic, Dan Prediksi Toksisitas Senyawa Turunan Alkaloid Naftiridin sebagai Inhibitor Protein Kasein Kinase 2-Α pada Kanker Leukemia. Pharmacoscript, 2(2), 131-151.

Pebriana, R. B., Romadhon, A. F., Yunianto, A., Rokhman, M. R., Fitriyah, N. Q., Jenie, R. I., & Meiyanto, E. 2012. Docking Kurkumin Dan Senyawa Analognya Pada Reseptor Progesteron: Studi Interaksinya Sebagai Selective Progesterone Receptor Modulators (SPRMs). Fakultas Farmasi Universitas Gajah Mada. Yogyakarta.

Pinzi, L., & Rastelli, G. 2019. Molecular Docking: Shifting Paradigms in Drug Discovery. International Journal of Molecular Sciences, 20(18), 4331.

Rachmania, R. A. Validasi Protokol Skrining Virtual dan Analisis Interaksi Inhibitor Antiproliferasi Sel Kanker Berbasis Bahan Alam Terhadap Reseptor Cyclin-Dependent Kinase 4 (CDK 4). Media Farmasi: Jurnal Ilmu Farmasi, 16(1), 21-40.

Schneider, G., & Baringhaus, K. H. 2008. Molecular Design: Concepts and Applications. John Wiley & Sons.

Sudoyo AW, Setiyohadi B, Alwi I, Simadibrata M, Setiati S. 2009. Buku Ajar Ilmu Penyakit Dalam Jilid II Edisi 5. Jakarta : Interna Publishing.

Trott, O. and Olson, A, J. 2009. AutoDock Vina : Improving The Speed and Accuracy of Docking with A New Scoring Function, Efficient Optimization, and Multithreading. Computational Chemistry. 31: 455-461.

Vyawahare, D., Ghodke, M. and Nikalje, A.P. 2010. Green synthesis and pharmacological screening of novel 1,5-Benzothiazepines as CNS agents. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, 2(2): 27–29.

Yaeghoobi, M. 2012. Synthesis of Chalcone-Based Six and Seven Membered Heterocyclic Compounds and Their Biological Activities Againt H1N1 Virus. Thesis. Faculty of Science. University of Malaya. Kuala Lumpur.

Yaeghoobi, M. 2016. Synthesis of Chalcone-Based Six and Seven Membered Heterocyclic Compounds and Their Biological Activities Againt H1N1 Virus. Thesis. Faculty of Science. Kuala Lumpur: University of Malaya.

##submission.downloads##

Diterbitkan

2021-12-31

Cara Mengutip

Frimayanti, N., Lukman, A., & Nathania , L. (2021). Studi molecular docking senyawa 1,5-benzothiazepine sebagai inhibitor dengue DEN-2 NS2B/NS3 serine protease. Chempublish Journal, 6(1), 54-62. https://doi.org/10.22437/chp.v6i1.12980